Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KNOP1Q1ED39 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.6 ms