Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms