Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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HIF1AQ16665 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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HIF1AQ16665 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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HIF1AQ16665 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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HIF1AQ16665 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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