Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
E2F4Q16254 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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