Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
GRIK4Q16099 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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