Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms