Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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