Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms