Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TUBA3CQ13748 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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