Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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