Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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