Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms