Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms