Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MAP3K1Q13233 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MAP3K1Q13233 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms