Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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TRAF3Q13114 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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