Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTP4A2Q12974 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms