Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms