Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CENPEQ02224 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CENPEQ02224 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms