Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3AP98173 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms