Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms