Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRAP18433 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRAP18433 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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