Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VGFO15240 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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