Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28O15084 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms