Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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