Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP35Q9P2H5 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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