Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC10Q9NYD6 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms