Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms