Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
IFNL1Q8IU54 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
IFNL1Q8IU54 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
IFNL1Q8IU54 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
IFNL1Q8IU54 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
IFNL1Q8IU54 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms