Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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C9orf47Q6ZRZ4 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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C9orf47Q6ZRZ4 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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C9orf47Q6ZRZ4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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C9orf47Q6ZRZ4 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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