Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
CCBE1Q6UXH8 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms