Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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C9orf135Q5VTT2 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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