Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF20Q5VTR2 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms