Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IMPG1Q17R60 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
IMPG1Q17R60 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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