Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPE65Q16518 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms