Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms