Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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CNGA3Q16281 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGA3Q16281 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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