Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USF2Q15853 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USF2Q15853 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USF2Q15853 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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