Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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ALX1Q15699 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ALX1Q15699 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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ALX1Q15699 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ALX1Q15699 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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ALX1Q15699 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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ALX1Q15699 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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ALX1Q15699 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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