Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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