Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms