Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYCP1Q15431 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SYCP1Q15431 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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