Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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HERC3Q15034 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC3Q15034 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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