Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SSPNQ14714 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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