Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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