Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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COL4A6Q14031 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL4A6Q14031 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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