Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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PDE6HQ13956 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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PDE6HQ13956 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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PDE6HQ13956 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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