Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
DDX39BQ13838 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
DDX39BQ13838 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
DDX39BQ13838 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms