Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MTMR3Q13615 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms