Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IRF5Q13568 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms