Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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